기본 콘텐츠로 건너뛰기

R dplyr 활용법

논문작성에 필요한 R ggplot2 데이터 시각화

Ch1. R dplyr 활용

0. 데이터 불러오기

다운로드 링크 : https://www.kaggle.com/daiearth22/uniqlo-fastretailing-stock-price-prediction

1. 집계 데이터 만들기

원하는 그래프를 그리려고 하다 보면, 가끔 데이터의 집계된 결과를 통해 그래프를 작성해야 될 떄가 있습니다. dplyr을 활용하면 데이터 집계 과정과 시각화 과정을 함께 할 수 있습니다. 시각화를 다루기 전에, 자주 쓰이는 dplyr 명령어들을 다루도록 하겠습니다.

  • group_by

    집계 기준 변수를 정해주는 명령어입니다.

  • summarise

    집계 기준 변수 및 명령어에 따라 요약값을 계산합니다.

  • ungroup

    group으로 묶인 데이터를 그룹 해제 시켜주는 명령어입니다.

    ungroup을 해주는 이유

    1. group_by를 통해 발생할 수 있는 error 방지를 합니다.
    1. group_by 여부에 따라 결과가 다르게 나옵니다.
  • count

    집계 기준에 따라 데이터의 row 갯수를 계산해줍니다. summarise 내에서 쓰인 length와 비슷한 같은 기능을 수행합니다.

2. 데이터 Sampling
  1. 조건에 따라 데이터 추출하기

    원하는 조건에 따라 데이터를 추출하는 명령어입니다. filter(), subset()을 활용하면 됩니다. 두 명령어 모두 같은 기능을 수행하니 편하신 명령어를 사용하면 됩니다.

  2. 데이터 중복 제거하기

    데이터에 내에 존재하는 중복데이터를 제거합니다. 명령어는 distinct()를 사용합니다.

    Group_Data는 25개의 행(row)로 구성되어 있으나, 중복을 허용하여 500개로 증가시켜버리면 중복데이터가 무조건 발생하게 됩니다.

    중복 제거를 한 후, 데이터의 행(row)이 25로 돌아온 것을 확인할 수 있습니다.

  3. 샘플 데이터 무작위 추출

    데이터의 행이 너무 많은 경우, 그래프를 그릴 때 연산속도가 오래 걸리며, R이 다운될 수 있는 문제가 있습니다. 그런 경우, 무작위로 샘플 데이터를 뽑아, 가볍게 시각화를 하는 것도 좋은 방법입니다. 명령어는 sample_frac(), sample_n()을 사용합니다. frac은 size에서 비율(0 ~ 1)을, n은 행의 갯수를 입력합니다.

    • group지정 여부에 따라 sample 결과가 다르게 나타납니다.

      각 년도에서 2개씩 균형있게 sampling된 것을 확인할 수 있습니다.

    • sample_n()

      각 년도별 2개씩 뽑힌 것을 확인할 수 있습니다. group이 적용되어 있는 경우에는 현재 데이터에서는 size 값을 5보다 큰 숫자를 설정할 수가 없습니다. (각 년도별 5개씩 데이터가 있기 때문)

      무작위로 10개가 뽑힌 것을 확인할 수 있습니다.

  4. 정해진 Index에 따라 데이터 추출하기

    무작위 추출이 아닌, 순서대로 뽑거나 원하는 구간만 설정해서 데이터를 뽑아내는 방법입니다. 명령어는 slice(), top_n()이 있습니다.

    • slice()는 Index를 직접 설정함으로, 원하는 구간만 추출할 수 있습니다. 이때 Dataset은 ungroup()이 되어 있는 데이터로 진행해야 됩니다.

    • top_n()은 설정해준 변수를 기준으로 가장 값이 높은 n개의 데이터를 가져옵니다.

  5. 데이터 정렬하기

    데이터를 특정 변수를 기준으로 정렬하는 방법입니다. arrange()를 이용합니다. 마찬가지로 ungroup()이 설정된 데이터로 정렬합니다. 만약 group_by()가 설정되어 있는 데이터를 기준으로 정렬 할 경우, Year별로 정렬합니다.

    • 오름차순

    • 내림차순

      내림차순은 변수에 '-'를 붙여주면 됩니다.

  6. 원하는 변수(Colomn)만 뽑아내기

    데이터를 핸들링 할 때, 모든 변수들을 가져갈 필요는 없습니다. 이런 경우 select(), select_if()를 활용하여 원하는 변수들을 뽑아낼 수 있습니다.

    • select()를 통해 원하는 변수를 뽑아낼 수 있습니다. 인덱스를 통해 뽑아도 되고, 변수명을 입력해서 뽑아내도 됩니다. 편하신 방법대로 하시면 됩니다.

    • select_if()를 통해 뽑는 조건을 줄 수 있습니다. 예를 들어, 데이터 타입에 따라 뽑아낼 수 있습니다.

      데이터 타입이 Factor인 변수만 뽑아서 데이터 셋을 만든 것을 확인할 수 있습니다.

  7. 새로운 변수 만들기 혹은 한번에 처리하기

    데이터 핸들링 과정에서 새로운 변수(Column)를 만들고자 할 때 필요한 기능입니다. 대표적으로는 mutate(), mutate_if(), mutate_at()이 있습니다.

    • mutate()는 하나의 변수를 명령어에 따라 추가하는 방법입니다.

    • mutate_if()은 지정해준 모든 변수에 대해 계산식을 적용시켜 줍니다. 예를 들어, 데이터의 타입을 변경하고 싶을 때, as.factor()같은 명령어를 하나씩 적용시키는 방법은 시간을 많이 잡아먹는 노가다 작업입니다. 이런 경우, mutate_if()를 통해 한번에 데이터 타입을 변경시켜줄 수 있습니다.

    • mutate_at()은 지정한 변수들에 대해 계산식을 적용시키는 명령어입니다.

      Date, Year, Day 변수를 제외하고 나머지 변수들은 모두 log 변환이 적용된 것을 확인할 수 있습니다.

여기까지 dplyr의 활용법을 다루었습니다. 모든 기능을 다룬 것은 아니고, 제 경험상 많이 썼던 기능들을 위주로 선별하였습니다. dplyr로 핸들링 한 후, %>%를 이용하여 바로 ggplot() 명령어와 연계할 수 있기 때문에 매우 효율적으로 작업을 할 수 있습니다.

 

댓글

이 블로그의 인기 게시물

6.1.2 고수들이 자주 쓰는 R코드 소개 2편 [중복 데이터 제거 방법]

Ch2. 중복데이터 제거하기 및 데이터 프레임 정렬 Ch2. 중복데이터 제거하기 및 데이터 프레임 정렬 흔하지는 않지만, 중복으로 입력되는 데이터 셋을 마주치는 일이 생기기 마련입니다. 보통 중복데이터는 데이터 수집단계에서 많이 발생합니다. 하지만 이를 하나하나 엑셀로 처리하는 것은 한계가 있기때문에, R에서 처리하는 방법에 대해 다루어 보고자 합니다. 1차원 벡터, 리스트에서의 중복 제거 A = rep(1:10, each = 2) # 1 ~ 10까지 2번씩 반복 print(A) ## [1] 1 1 2 2 3 3 4 4 5 5 6 6 7 7 8 8 9 9 10 10 # 중복 제거 unique(A) ## [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 데이터 프레임에서의 중복 제거 다음과 같은 데이터 프레임을 예시로 삼겠습니다. 변수 설명 OBS : 번호 NAME : 환자 이름 ID : 환자 고유번호 DATE : 검사 날짜 BTW : Body total water 먼저, 환자 이름이 있고, 그 환자의 고유 ID가 있습니다. 세상에 동명이인은 많기 때문에 항상 고유 ID를 기록해둡니다. # 데이터 불러오기 DUPLICATE = read.csv("C:/R/DUPLICATED.csv") DUPLICATE ## OBS NAME ID DATE BTW ## 1 1 A A10153 2018-11-30 1 ## 2 2 A A10153 2018-11-30 3 ## 3 3 B B15432 2018-11-30 4 ## 4 4 A A15853 2018-11-29 5 ## 5 5 C C54652 2018-11-28 5 ## 6 6 C C54652 2018-11-27 6 ## 7 7 D D14

4.4.1 R 문자열(TEXT) 데이터 처리하기 1

Ch4. 문자열 데이터 다루기 1 데이터 다운로드 링크: https://www.kaggle.com/PromptCloudHQ/imdb-data # 데이터 불러오기 DATA=read.csv("C:\\R/IMDB-Movie-Data.csv") Ch4. 문자열 데이터 다루기 1 이번에는 문자열 데이터를 처리하는 방법에 대해 다루겠습니다. 문자열을 다룰 때 기본적으로 숙지하고 있어야 하는 명령어는 다음과 같습니다. 문자열 대체 : gsub() 문자열 분리 : strsplit() 문자열 합치기 : paste() 문자열 추출 : substr() 텍스트마이닝 함수: Corpus() & tm_map(), & tdm() # 문자열 추출 substr(DATA$Actors[1],1,5) # 첫번째 obs의 Actors변수에서 1 ~ 5번째에 해당하는 문자열 추출 ## [1] "Chris" # 문자열 붙이기 paste(DATA$Actors[1],"_",'A') # 첫번째 obs의 Actors변수에서 _ A 붙이기, 기본적으로 띄어쓰기르 구분 ## [1] "Chris Pratt, Vin Diesel, Bradley Cooper, Zoe Saldana _ A" paste(DATA$Actors[1],"_",'A',sep="") # 띄어쓰기 없이 붙이기 ## [1] "Chris Pratt, Vin Diesel, Bradley Cooper, Zoe Saldana_A" paste(DATA$Actors[1],"_","Example",sep="|") # |로 붙이기 ## [1] "Chris Pratt, Vin Diesel, Bradley Cooper, Zoe Saldana|

3. Resampling 방법론(Leave one out , Cross Validation)

Ch4. Resampling 방법론 이전 챕터에서는 앙상블에 대해 다루었습니다. 앙상블을 요약하자면, Training Set을 Resampling할 때 마다, 가중치를 조정할 것인지 말 것인지를 다루는 내용이었습니다. 이번에는 구체적으로 Resampling 방법들에 대해 다루어 보고자 합니다. 1. Resampling의 목적과 접근 방식 모형의 변동성(Variability)을 계산하기 위해서 입니다. Training Set으로 모형을 만들고, Test Set으로 Error rate를 계산하며, 이를 반복합니다. 각 실행 별, Error Rate 값이 계산이 될 것이며, 해당 Error rate의 분포를 보고 모형의 성능을 평가할 수 있습니다. Model Selection : 모형의 성능을 Resampling 방법론을 통해 평가한다면, 모델링 과정에서 어떤 변수를 넣어야 하고, 혹은 모형의 유연성(Flexibility)을 어느정도로 조절하는 것이 적당한지 결정을 할 수 있기 때문에 매우 중요한 방법론 중 하나입니다. 모형의 유연성에 대해서는 다음 챕터에서 설명하도록 하겠습니다. 2. Leave-One-Out Cross Validation(LOOCV) LOOCV는 n개의 데이터에서 1개를 Test Set으로 정하고 나머지 n-1개의 데이터로 모델링을 하는 방법을 의미합니다. LOOCV 방법은 데이터 수 n이 크다면, n번의 모델링을 진행해야되기 때문에, 시간이 오래 걸립니다. 회귀, 로지스틱, 분류모형 등에 다양하게 적용할 수 있습니다. 3. K - Fold Cross - Validation 연산시간이 오래걸린 다는 것은 곧, 작업시간이 길어진다는 의미이며 이는 곧 야근을 해야된다는 소리와 다를게 없어집니다. 그래서 시간이 오래걸리는 LOOCV를 대채하기 위하여 K-Fold Cross - Validation이 존재합니다. 위 그림은 데이터 셋을 총 4개의 Set로 구성하였습니다. Cross -

4. 통계적 추정(점추정,구간추정)

Ch1. 점추정 추정량은 우리가 알고 싶어하는 모수를 표본들을 이용하여 단 하나의 점으로 추측하는 통계량입니다. 그 과정을 점추정(Point estimation)이라고 하며, 그렇게 얻어진 통계량을 점주청량(Point estimator)라고 합니다. 점추정량은 다양한 방식으로 구할 수 있습니다. 모평균을 추정하기 위한 표본평균 계산 각 끝의 일정 부분씩은 무시하고 나머지 표본들의 평균 계산(절삭 평균, Trimmed Mean) 등의 방법들이 있습니다. 하지만 가장 많이 쓰는 척도는 표본평균입니다. 그 이유는 대표적으로 수리적인 확장성과 표본평균의 분포를 비교적 쉽게 알 수 있다는 점을 들 수 있습니다. 점추정은 단순히 모평균을 추정하는 것만이 아닌, 회귀식을 추정하였을 때의 회귀계수도 점추정이라고 할 수 있습니다. (회귀분석은 후에 다룰 예정입니다.) 다만, 이런 점추정에도 몇 가지의 장점과 단점이 있습니다. 점추정의 장점 점추정량은 지극히 직관적이다. 통계를 모르는 누군가가 한국의 30대 여성의 평균 수입을 묻는다면 점추정량으로 즉각적인 답을 줄 수 있을 것입니다. 점추정량은 매우 직관적이며 합리적입니다. 점추정량은 우리가 원하는 수치를 대체할 구체적인 값을 제시해준다. 우리가 통계적인 모델링 혹은 함수를 작성하기 위해 30대 여성 수입의 평균치가 필요하나 모평균을 알 수 없을 때 점추정량으로 간단히 대체할 수 있습니다. 사실상 이는 대부분에 통계이론을 전개하는데 가장 중요한 역할을 합니다. 간단한 예를 말씀드리자면 모분산을 추정하기 위해서는 평균이 필요하기 때문에 표본평균을 이용합니다. 여기서 분산은 각 개별 값들이 평균에서 얼만큼 멀리 떨어져있는지에 대한 척도입니다. 그런데 우리는 '진짜 평균'을 알 수 없으니 아래 식과 같이 표본들의 평균으로 대체하는 것입니다. 여기서 평균 값을 표본평균으로 대체하였기에 표본분산은 n이 아닌 n-1으로 나누어 주게 됩니다. 이해를 돕기 위해 자유도에 대한 개념을 잠깐 다루도록 하

3.2.3 R 시각화[ggplot2] 2편 (히스토그램, 밀도글래프, 박스플롯, 산점도)

R 데이터 시각화 2편 R 데이터 시각화 2편 데이터 다운로드 링크: https://www.kaggle.com/liujiaqi/hr-comma-sepcsv # 시각화 이전에 처리 되어 있어야 하는 시각화 DATA = read.csv('C:/R/HR_comma_sep.csv') DATA$left = as.factor(DATA$left) DATA$Work_accident = as.factor(DATA$Work_accident) DATA$promotion_last_5years = as.factor(DATA$promotion_last_5years) 히스토그램(Histogram) [연속형 변수 하나를 집계 내는 그래프, 1차원] 히스토그램은 연속형변수를 일정 범위로 구간을 만들어, x축으로 설정하고 y축은 집계된 값(Counting)을 나타내는 그래프입니다. library(ggplot2) # 기본 ggplot(DATA,aes(x=satisfaction_level))+ geom_histogram() ## `stat_bin()` using `bins = 30`. Pick better value with `binwidth`. # 구간 수정 및 색 입히기 ggplot(DATA,aes(x=satisfaction_level))+ geom_histogram(binwidth = 0.01,col='red',fill='royalblue') # col은 테두리, fill은 채우기 밀도그래프(Density Plot)[연속형 변수 하나를 집계 내는 그래프, 1차원] 밀도그래프는 연속형변수를 일정 범위로 구간을 만들어, x축으로 설정하고 y축은 집계된 값(percentage)을 나타내는 그래프입니다. # 기본 ggplot(DATA,aes(x=satisfaction_level))+ geom_density() # 색 입히기 ggplot(DATA,a