기본 콘텐츠로 건너뛰기

2. 그래프 전체 수록

1. barchart
  • x축 변수 1개로만 그리는 경우

  • x축, y축 변수 2개로 그리는 경우, stat = 'identity' 사용합니다.

2. histogram
  • 주로 binwidth옵션을 사용하여 그래프 조정합니다.

3. density plot
  • 히스토그램과 비슷하게 작성합니다.

4. boxplot & jitter plot
  • x축은 Descrete 변수를, y축에는 Continuous 변수를 배치해야합니다.

5. violin plot
  • 박스플롯과 그리는 방법은 동일합니다.

6. scatter plot
  • 두 변수 모두 Continuous 변수를 넣되, size, shape 등을 자유롭게 바꿀 수 있습니다.

7. smooth plot
  • geom_smooth()에서 주로 건드리는 옵션은 method, se옵션입니다.

8. abline, vline, hline
  • 그래프에 보조선을 추가하고 싶을 때, geom_abline(), geom_vline(), geom_hline()을 이용하여 선을 그릴 수가 있습니다.

    • geom_vline() : 수직선
    • geom_hline() : 수평선
    • geom_abline() : 절편, 기울기를 줘서 작성하는 직선

9. step plot
  • geom_step()은 이후에 그릴 line 그래프와 매우 비슷한 그래프입니다. 특히 생존시간에 따른 Hazard Ratio를 표현하기 매우 좋습니다.

10. density_2d plot
  • 2차원 평면 상에서 밀도 그래프를 표시하고자 하는 그래프입니다. geom_density2d()를 사용합니다.

11. Text plot
  • Scatter Plot을 그리는 것과 같은 원리입니다. 하지만 geom_text()는 점 대신에 지정해준 텍스트를 그래프상에 표시합니다.

12. line plot & Time Series Plot
  • geom_line()은 먼저 데이터가 x축 변수와 y축 변수가 1 대 1 매칭이 되는지 확인을 하여야 합니다. 만약 그렇지 않은 경우, 그래프가 이상하게 나오는 것을 확인할 수가 있습니다.

  • line plot은 항상 group 옵션을 지정해 주어야 합니다. 기본적으로 선을 1개 그리려고 할 때는 group = 1을 설정하고, 색으로 구분해서 그릴 경우는 구분 변수를 설정해주면 됩니다.

    이런 경우는 x축과 y축 변수가 1 대 1 매칭이 되지 않았기에 생긴 문제입니다. 그렇기에 geom_line()그래프를 그릴 때는 종종 집계된 데이터를 활용하여 그리는 것이 맞습니다. 지금은 1대1 매칭이 되는 Date 변수를 x축으로 하여 그래프를 그리도록 하겠습니다.

13. Vertical Error bar plot
  • geom_errorbar()을 이용하여 그래프에 편차, 범위 등의 정보를 표현해줄 수 있습니다.

  • ymin. ymax을 통해 error bar plot의 범위를 정해줍니다.

14. Horizontal Error bar
  • geom_errorbarh()을 이용하면 x축을 기준으로 하는 error bar plot을 그릴 수 있습니다.

15. Corr plot
  • corrplot 패키지를 이용하면 상관계수를 이용하여 그래프를 그릴 수가 있습니다.

16. Heat map
  • 히트맵은 두 Descrete 변수를 기준으로 집계된 데이터를 통해 만들 수 있습니다.

17. Ribbon Plot
  • geom_ribbon()은 error bar plot의 라인 버전이라고 생각하시면 됩니다.

18. Ridge Plot
  • geom_density_ridges_gradient()을 활용하면 density plot을 여러 축에 나눠서 그릴 수가 있습니다.

19. Area Plot
  • geom_area()을 활용하여 누적 영역 그래프를 그릴 수가 있습니다.

20. Polygon Plot
  • geom_polygon()이라는 명령어가 있지만, 해당 명령어는 쓰기가 조금 까다롭습니다. 요구하는 데이터 입력 방식이 간단하지가 않습니다. 그렇기 때문에 stat_ellipse()명령어를 사용하여 polygon 플랏을 그리도록 하겠습니다.

  • stat_ellipse()처럼 stat으로 시작하는 명령어는 옵션에 geom = 'polygon' 처럼 어떻게 그래프를 그릴 것인지 옵션을 주어야 합니다.

21. Rect Plot(Waterfall Chart)
  • geom_rect()를 이용하여 정사각형 그래프를 그릴 수가 있습니다. 이 그래프를 이용하여 널리 알려진 waterfall chart를 그릴 수가 있습니다.

댓글

이 블로그의 인기 게시물

6.1.2 고수들이 자주 쓰는 R코드 소개 2편 [중복 데이터 제거 방법]

Ch2. 중복데이터 제거하기 및 데이터 프레임 정렬 Ch2. 중복데이터 제거하기 및 데이터 프레임 정렬 흔하지는 않지만, 중복으로 입력되는 데이터 셋을 마주치는 일이 생기기 마련입니다. 보통 중복데이터는 데이터 수집단계에서 많이 발생합니다. 하지만 이를 하나하나 엑셀로 처리하는 것은 한계가 있기때문에, R에서 처리하는 방법에 대해 다루어 보고자 합니다. 1차원 벡터, 리스트에서의 중복 제거 A = rep(1:10, each = 2) # 1 ~ 10까지 2번씩 반복 print(A) ## [1] 1 1 2 2 3 3 4 4 5 5 6 6 7 7 8 8 9 9 10 10 # 중복 제거 unique(A) ## [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 데이터 프레임에서의 중복 제거 다음과 같은 데이터 프레임을 예시로 삼겠습니다. 변수 설명 OBS : 번호 NAME : 환자 이름 ID : 환자 고유번호 DATE : 검사 날짜 BTW : Body total water 먼저, 환자 이름이 있고, 그 환자의 고유 ID가 있습니다. 세상에 동명이인은 많기 때문에 항상 고유 ID를 기록해둡니다. # 데이터 불러오기 DUPLICATE = read.csv("C:/R/DUPLICATED.csv") DUPLICATE ## OBS NAME ID DATE BTW ## 1 1 A A10153 2018-11-30 1 ## 2 2 A A10153 2018-11-30 3 ## 3 3 B B15432 2018-11-30 4 ## 4 4 A A15853 2018-11-29 5 ## 5 5 C C54652 2018-11-28 5 ## 6 6 C C54652 2018-11-27 6 ## 7 7 D D14

4.4.1 R 문자열(TEXT) 데이터 처리하기 1

Ch4. 문자열 데이터 다루기 1 데이터 다운로드 링크: https://www.kaggle.com/PromptCloudHQ/imdb-data # 데이터 불러오기 DATA=read.csv("C:\\R/IMDB-Movie-Data.csv") Ch4. 문자열 데이터 다루기 1 이번에는 문자열 데이터를 처리하는 방법에 대해 다루겠습니다. 문자열을 다룰 때 기본적으로 숙지하고 있어야 하는 명령어는 다음과 같습니다. 문자열 대체 : gsub() 문자열 분리 : strsplit() 문자열 합치기 : paste() 문자열 추출 : substr() 텍스트마이닝 함수: Corpus() & tm_map(), & tdm() # 문자열 추출 substr(DATA$Actors[1],1,5) # 첫번째 obs의 Actors변수에서 1 ~ 5번째에 해당하는 문자열 추출 ## [1] "Chris" # 문자열 붙이기 paste(DATA$Actors[1],"_",'A') # 첫번째 obs의 Actors변수에서 _ A 붙이기, 기본적으로 띄어쓰기르 구분 ## [1] "Chris Pratt, Vin Diesel, Bradley Cooper, Zoe Saldana _ A" paste(DATA$Actors[1],"_",'A',sep="") # 띄어쓰기 없이 붙이기 ## [1] "Chris Pratt, Vin Diesel, Bradley Cooper, Zoe Saldana_A" paste(DATA$Actors[1],"_","Example",sep="|") # |로 붙이기 ## [1] "Chris Pratt, Vin Diesel, Bradley Cooper, Zoe Saldana|

3. Resampling 방법론(Leave one out , Cross Validation)

Ch4. Resampling 방법론 이전 챕터에서는 앙상블에 대해 다루었습니다. 앙상블을 요약하자면, Training Set을 Resampling할 때 마다, 가중치를 조정할 것인지 말 것인지를 다루는 내용이었습니다. 이번에는 구체적으로 Resampling 방법들에 대해 다루어 보고자 합니다. 1. Resampling의 목적과 접근 방식 모형의 변동성(Variability)을 계산하기 위해서 입니다. Training Set으로 모형을 만들고, Test Set으로 Error rate를 계산하며, 이를 반복합니다. 각 실행 별, Error Rate 값이 계산이 될 것이며, 해당 Error rate의 분포를 보고 모형의 성능을 평가할 수 있습니다. Model Selection : 모형의 성능을 Resampling 방법론을 통해 평가한다면, 모델링 과정에서 어떤 변수를 넣어야 하고, 혹은 모형의 유연성(Flexibility)을 어느정도로 조절하는 것이 적당한지 결정을 할 수 있기 때문에 매우 중요한 방법론 중 하나입니다. 모형의 유연성에 대해서는 다음 챕터에서 설명하도록 하겠습니다. 2. Leave-One-Out Cross Validation(LOOCV) LOOCV는 n개의 데이터에서 1개를 Test Set으로 정하고 나머지 n-1개의 데이터로 모델링을 하는 방법을 의미합니다. LOOCV 방법은 데이터 수 n이 크다면, n번의 모델링을 진행해야되기 때문에, 시간이 오래 걸립니다. 회귀, 로지스틱, 분류모형 등에 다양하게 적용할 수 있습니다. 3. K - Fold Cross - Validation 연산시간이 오래걸린 다는 것은 곧, 작업시간이 길어진다는 의미이며 이는 곧 야근을 해야된다는 소리와 다를게 없어집니다. 그래서 시간이 오래걸리는 LOOCV를 대채하기 위하여 K-Fold Cross - Validation이 존재합니다. 위 그림은 데이터 셋을 총 4개의 Set로 구성하였습니다. Cross -

4. 통계적 추정(점추정,구간추정)

Ch1. 점추정 추정량은 우리가 알고 싶어하는 모수를 표본들을 이용하여 단 하나의 점으로 추측하는 통계량입니다. 그 과정을 점추정(Point estimation)이라고 하며, 그렇게 얻어진 통계량을 점주청량(Point estimator)라고 합니다. 점추정량은 다양한 방식으로 구할 수 있습니다. 모평균을 추정하기 위한 표본평균 계산 각 끝의 일정 부분씩은 무시하고 나머지 표본들의 평균 계산(절삭 평균, Trimmed Mean) 등의 방법들이 있습니다. 하지만 가장 많이 쓰는 척도는 표본평균입니다. 그 이유는 대표적으로 수리적인 확장성과 표본평균의 분포를 비교적 쉽게 알 수 있다는 점을 들 수 있습니다. 점추정은 단순히 모평균을 추정하는 것만이 아닌, 회귀식을 추정하였을 때의 회귀계수도 점추정이라고 할 수 있습니다. (회귀분석은 후에 다룰 예정입니다.) 다만, 이런 점추정에도 몇 가지의 장점과 단점이 있습니다. 점추정의 장점 점추정량은 지극히 직관적이다. 통계를 모르는 누군가가 한국의 30대 여성의 평균 수입을 묻는다면 점추정량으로 즉각적인 답을 줄 수 있을 것입니다. 점추정량은 매우 직관적이며 합리적입니다. 점추정량은 우리가 원하는 수치를 대체할 구체적인 값을 제시해준다. 우리가 통계적인 모델링 혹은 함수를 작성하기 위해 30대 여성 수입의 평균치가 필요하나 모평균을 알 수 없을 때 점추정량으로 간단히 대체할 수 있습니다. 사실상 이는 대부분에 통계이론을 전개하는데 가장 중요한 역할을 합니다. 간단한 예를 말씀드리자면 모분산을 추정하기 위해서는 평균이 필요하기 때문에 표본평균을 이용합니다. 여기서 분산은 각 개별 값들이 평균에서 얼만큼 멀리 떨어져있는지에 대한 척도입니다. 그런데 우리는 '진짜 평균'을 알 수 없으니 아래 식과 같이 표본들의 평균으로 대체하는 것입니다. 여기서 평균 값을 표본평균으로 대체하였기에 표본분산은 n이 아닌 n-1으로 나누어 주게 됩니다. 이해를 돕기 위해 자유도에 대한 개념을 잠깐 다루도록 하

3.2.3 R 시각화[ggplot2] 2편 (히스토그램, 밀도글래프, 박스플롯, 산점도)

R 데이터 시각화 2편 R 데이터 시각화 2편 데이터 다운로드 링크: https://www.kaggle.com/liujiaqi/hr-comma-sepcsv # 시각화 이전에 처리 되어 있어야 하는 시각화 DATA = read.csv('C:/R/HR_comma_sep.csv') DATA$left = as.factor(DATA$left) DATA$Work_accident = as.factor(DATA$Work_accident) DATA$promotion_last_5years = as.factor(DATA$promotion_last_5years) 히스토그램(Histogram) [연속형 변수 하나를 집계 내는 그래프, 1차원] 히스토그램은 연속형변수를 일정 범위로 구간을 만들어, x축으로 설정하고 y축은 집계된 값(Counting)을 나타내는 그래프입니다. library(ggplot2) # 기본 ggplot(DATA,aes(x=satisfaction_level))+ geom_histogram() ## `stat_bin()` using `bins = 30`. Pick better value with `binwidth`. # 구간 수정 및 색 입히기 ggplot(DATA,aes(x=satisfaction_level))+ geom_histogram(binwidth = 0.01,col='red',fill='royalblue') # col은 테두리, fill은 채우기 밀도그래프(Density Plot)[연속형 변수 하나를 집계 내는 그래프, 1차원] 밀도그래프는 연속형변수를 일정 범위로 구간을 만들어, x축으로 설정하고 y축은 집계된 값(percentage)을 나타내는 그래프입니다. # 기본 ggplot(DATA,aes(x=satisfaction_level))+ geom_density() # 색 입히기 ggplot(DATA,a